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학과소개

최첨단 연구와 교육이 이루어지는 학과소개 교수진 교수 이과대학 생물학과 홈페이지 입니다.

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서브 컨텐츠

김권일 교수

김권일 교수
 
Contact Information
• 영문이름 : Kwoneel Kim
• 전공분야 : 생물정보학
• 학      위 : 공학박사
• 연 락 처 : 02-961-9612
• 직      책 : 조교수
• 담당과목 : 후성유전학, 생물정보학, 생물정보학실습
• 팩스번호 : 02-961-9155
• E-mail : kwoneelkim@khu.ac.kr
• 홈페이지 : http://www.sysbioinfo.com
 
주요 약력
2018 - 현재 경희대학교 생물학과 조교수
2017 - 2018 서울아산병원 임상의학연구소 특수전문학자
2015 - 2017 KAIST 정보전자연구소 Post-Doc
2011 - 2015 KAIST 바이오및뇌공학과 공학박사
2009 - 2011 UST 기능유전체학과 이학석사
2005 - 2009 건국대학교 응용생물학과 이학사
 
연구분야

MAIN RESEARCH THEME
Unraveling disease complexity by leveraging big data and machine learning based on concrete biological assumptions

경희대학교 시스템생물정보학 연구실은 오믹스 데이터를 대상으로 생물정보학 및 시스템생물학 접근법을 적용하여 알맞게 고안된 생물학적 가정하에 생명현상을 이해하고자 하는 연구들을 수행하고 있습니다. 이는 최신의 기계학습 및 인공지능 등 전산통계학적 접근법을 포함합니다. 위 접근들을 통해 생물학적 난제나 암과 같은 복잡 질환을 해결하기 위한 실마리를 제시하고자 합니다.


CURRENT RESEARCH TOPICS
1. Understanding the tumor immune microenvironment and metabolism
암 면역 미세환경 및 대사의 개별 요소 간 상호작용에 대한 통합적 이해
2. Multi-omics approach for identifying therapeutic targets in complex diseases
다중오믹스 상호작용에 기반한 복잡 질병 치료 타겟 발굴
3. Epigenetic understanding of the environmental influence on allergic diseases
알레르기 질환과 환경 간 상호작용에 대한 후성유전학 중심 연구
4. Kinase phosphorylation
인산화 양상 예측에 기반한 세포 신호 전달 연구


 
 연구논문

1.     Park, J. S., & Kim, K. (2022). Antigen Coverage Presented by MHC Class I Has a Negative Correlation with SARS-CoV-2-Induced Mortality. Vaccines, 10(11), 1917.

2.     Bang, H., Park, J. S., Kim, J. Y., Sung, C., An, J., Cho, D. Y., ... & Kim, K. (2022). Gene essentiality for tumour growth influences neoantigendirected immunoediting. Clinical and Translational Medicine, 12(1).

3.     Kim, J. H.*, Kim, K.*, Yeom, J.*, Lee, E., Kang, M. J., Lee, S. H., ... & Hong, S. J. (2021). Integrative multiomics approach for mechanism of humidifier disinfectantassociated lung injury. Clinical and translational medicine, 11(11). *Co-first

4.     Cho, S. H., Yoon, S., Lee, D. H., Kim, S. W.* & Kim, K.*(2021). Recurrence-associated gene signature in patients with stage I non-small-cell lung cancer. Scientific reports, 11(1), 1-10.

5.     Kim, S. Y.* Kim, K.* Cho, S. H., Chun, S. M., Tak, E., Hong, Y. S., ... & Kim, T. W. (2021). Longitudinal change of genetic variations in cetuximab-treated metastatic colorectal cancer. Cancer genetics, 258, 27-36. *Co-first

6.     Lee, S., Kim, Y. N., Im, D., Cho, S. H., Kim, J., Kim, J. H., & Kim, K. (2021). DNA Methylation and gene expression patterns are widely altered in fetal growth restriction and associated with FGR development. Animal Cells and Systems, 25(3), 128-135.

7.     Lee, K. S., Bang, H., Choi, J. K., & Kim, K. (2020). Accelerated evolution of the regulatory sequences of brain development in the human genome. Molecules and cells, 43(4), 331.

8.     Kim, K., Kim, H. S., Kim, J. Y., Jung, H., Sun, J. M., Ahn, J. S., ... & Choi, J. K. (2020). Predicting clinical benefit of immunotherapy by antigenic or functional mutations affecting tumour immunogenicity. Nature communications, 11(1), 1-11.

9.     Jung, G. T., Kim, K. P., & Kim, K. (2020). How to interpret and integrate multi-omics data at systems level. Animal Cells and Systems, 24(1), 1-7.

10.  Jang, K.* Kim, K.* Cho, A., Lee, I., & Choi, J. K. (2017). Network perturbation by recurrent regulatory variants in cancer. PLoS computational biology, 13(3), e1005449. *Co-first

11.  Kim, K., Jang, K., Yang, W., Choi, E. Y., Park, S. M., Bae, M., ... & Choi, J. K. (2016). Chromatin structure–based prediction of recurrent noncoding mutations in cancer. Nature genetics, 48(11), 1321-1326.

12.  Kim, K., Lee, K., Bang, H., Kim, J. Y., & Choi, J. K. (2016). Intersection of genetics and epigenetics in monozygotic twin genomes. Methods, 102, 50-56.

13.  Kim, K., Yang, W., Lee, K. S., Bang, H., Jang, K., Kim, S. C., ... & Choi, J. K. (2015). Global transcription network incorporating distal regulator binding reveals selective cooperation of cancer drivers and risk genes. Nucleic acids research, 43(12), 5716-5729.

14.  Kim, K., Bang, H., Lee, K., & Choi, J. K. (2015). Genetic Architecture of Transcription and Chromatin Regulation. Genomics & informatics, 13(2), 40.

15.  Kim, K., Ban, H. J., Seo, J., Lee, K., Yavartanoo, M., Kim, S. C., ... & Choi, J. K. (2014). Genetic factors underlying discordance in chromatin accessibility between monozygotic twins. Genome biology, 15(5), 1-13.

16.  Seo, J., Kim, K., Chang, D. Y., Kang, H. B., Shin, E. C., Kwon, J., & Choi, J. K. (2013). Genome-wide reorganization of histone H2AX toward particular fragile sites on cell activation. Nucleic acids research, 42(2), 1016-1025.

17.  Kim, H. C., Kim, Y. S., Oh, H. W., Kim, K., Oh, S. S., Kim, J. T., ... & Lee, H. G. (2014). Collagen triple helix repeat containing 1 (CTHRC1) acts via ERK-dependent induction of MMP9 to promote invasion of colorectal cancer cells. Oncotarget, 5(2), 519.

18.  Chai, X., Nagarajan, S., Kim, K., Lee, K., & Choi, J. K. (2013). Regulation of the boundaries of accessible chromatin. PLoS genetics, 9(9), e1003778.

19.  Lee, K., Kim, S. C., Jung, I., Kim, K., Seo, J., Lee, H. S., ... & Choi, J. K. (2013). Genetic landscape of open chromatin in yeast. PLoS genetics, 9(2), e1003229.

20.  Kim, K., Lee, H. C., Park, J. L., Kim, M., Kim, S. Y., Noh, S. M., ... & Kim, Y. S. (2011). Epigenetic regulation of microRNA-10b and targeting of oncogenic MAPRE1 in gastric cancer. Epigenetics, 6(6), 740-751.h SM, Song KS, Kim JC, Kim YS. Epigenetic regulation of microRNA-10b and targeting of oncogenic MAPRE1 in gastric cancer. Epigenetics. 6,740-751 (2011).

 
 특허

1.     최정균양우진김권일. 10,000개 이상 유전자 간의 전사조절 네트워크 구축 알고리즘과 이를 이용한 약물반응 원인 유전자 발굴 방법

       대한민국특 허청출원 번호: 10-2015-0063824.

2.     최정균김권일암 세포 표면의 MHC-펩타이드 결합도 예측 방법 및 분석 장치대한민국특허청출원 번호: 10-2019-0125897.

3.     최정균김권일면역항암제에 대한 저항성을 예측하는 방법 및 분석장치대한민국특허청출원 번호: 10-2019-0123919.

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